Амвросиевская церковь — единственный сохранившийся больничный храм XVI века в Москве. Первоначально деревянная церковь существовала уже к 1550-м, но каменный одноглавый четверик над палатами казначейского корпуса воздвигли около 1580 г. В XVII в. его надстроили кружалом и звонницей с ажурными кокошниками, что придало зданию характерный силуэт. Здесь подвизалась царевна Ирина Годунова; к её кельям вела тёплая галерея-переход, восстановленная в 2020-м.
В отличие от парадных храмов, Амвросиевская церковь имела скромный интерьер: известковая побелка, низкий трёхъярусный иконостас и деревянный клирос, приспособленный для больничных носилок. В 1930-е годы помещение служило книгохранилищем Института востоковедения, что и спасло уникальные рукописные фолианты от сожжения. С 2022 г. храм вновь действует, богослужения совершаются каждую субботу для сестёр монастырского лазарета.
Археологические раскопки 2018 г. выявили фундаменты раннего деревянного корпуса, позволив окончательно датировать постройку. Консервация выполнена открытым методом — кирпичный «ковёр» на газоне обозначает план древней больницы, доступный туристам для осмотра.