Строительство храма было завершено в 1814 году. Архитектурный проект храма приписывается известному зодчему Матвею Фёдоровичу Казакову, однако документальных подтверждений этому нет. Храм выполнен в стиле ампир, характерном для того периода. Кирпичное оштукатуренное здание имеет световую купольную ротонду, установленную на массивный четверик, прорезанную люкарнами. По бокам расположены притворы, украшенные тосканскими портиками с фронтонами. Трёхъярусная колокольня с небольшими фронтонами и круглыми окнами во втором ярусе завершается высоким шпилем на куполе. Внутреннее пространство храма организовано сложным образом: центр повышен, ротонду изнутри поддерживает восьмигранник; в куполе сохранились масляные росписи начала XX века. В трапезной четыре колонны поддерживают деревянные коробовые своды, сохранились росписи начала XIX века.
В 1948 году священнослужителям было запрещено проводить богослужения, и храм был закрыт. В 1958 году здание подверглось разграблению и пришло в запустение; иконы и церковная утварь исчезли.
В 1991 году храм был возвращён Русской Православной Церкви. С этого времени начались восстановительные работы, направленные на возрождение храма и его возвращение к полноценной богослужебной деятельности.
В настоящее время Казанский храм в деревне Кленково является действующим и относится к Клинскому благочинию Московской епархии Русской Православной Церкви. Богослужения совершаются регулярно, при храме ведётся активная приходская жизнь, организуются мероприятия для прихожан и жителей деревни.
