Иоанно-Предтеченский скит – особая, уединённая часть Оптиной пустыни, предназначенная для более строгой монашеской жизни. Он был основан в 1821 году по благословению Калужского архиерея свт. Филарета (Амфитеатрова) на небольшом удалении от основного монастыря. Устроением скита занимались старцы Моисей и Антоний, перенявшие пустынножительство от рославльских отшельников. При основании скита решили сохранить окружающий его лес – деревья вокруг не рубили, чтобы обитель старцев навсегда оставалась закрытой от мирской суеты. В 1822 году на территории скита была построена первая деревянная церковь во имя св. Иоанна Предтечи, срубленная из тех самых сосен, что росли на месте скита. Скит стал сердцем Оптиной пустыни: здесь несли своё служение знаменитые оптинские старцы, и отсюда исходило духовное окормление множества паломников в XIX веке.
Иоанно-Предтеченский скит сохраняет свой уединённый статус и сегодня. В скиту продолжаются круглосуточные молитвы по особому скитскому уставу, где чередуются монашеские правила и богослужения. Братия скита невелика (около 10 монахов), и доступ для мирян на его территорию ограничен: с 2013 года вход для паломников в скит закрыт (открывается лишь несколько раз в году на великие праздники). Тем не менее, сам скит виден со стороны – за монастырской рощей можно различить ограду и купола скитских храмов. На скитском дворе сохранились старые деревянные домики-келии XIX века, в которых останавливались такие известные посетители, как Н.В.Гоголь, Ф.М.Достоевский, К.Н.Леонтьев. Иоанно-Предтеченский скит – живое предание Оптиной пустыни, место, где и сегодня продолжается подвижническая традиция оптинского старчества. У входа в скит по благословению старца Амвросия в XIX веке вырыли колодец, освящённый в честь святителя Амвросия Медиоланского; вода из него отличалась особой чистотой и считалась целебной. Некоторое время возобновлялись братские крестные ходы на колодец для водоосвящения. Современная надкладезная часовня над источником построена по дореволюционным фотографиям – её металлический шатёр с маленькой главкой и крестом практически полностью повторяет исторический вид; под шатром помещена икона святителя Амвросия Медиоланского. Скитский колодец с часовней – часть духовного наследия Оптиной пустыни, напоминающая о вере оптинских старцев и милости Божией.