Первое документальное упоминание о церкви датируется 1646 годом, однако предполагается, что она была возведена в период восстановления Ладоги после Смутного времени. В 1731 году обветшавшую церковь разобрали, пригодные брёвна использовали для строительства новой. В 1782 году храм пострадал от пожара, в результате которого сгорели кровля и главка, были повреждены иконы.
В 1901 году церковь была вновь перестроена, установлена на каменный фундамент. Здание сохранило традиционную структуру: притвор, трапезная и собственно церковь объединены в одно целое; с востока прирублен пятигранный алтарь. Верх церкви увенчан луковичной главкой, покрытой лемехом.
В настоящее время церковь не действует как храм, но используется для музейных целей. Внутри размещена экспозиция, посвящённая фрескам церкви святого Георгия XII века, включающая образцы строительного материала, фотографии сохранившихся фресок и фрагменты настенной живописи.