Согласно преданию, монастырь был основан в 1241 году князем Александром Невским в память о победе над шведскими войсками в Невской битве 1240 года. Однако первые документальные упоминания об обители относятся к концу XV века. В оброчных переписных книгах Обонежской пятины 1496 года и Водской пятины 1499–1500 годов за монастырем числились 20 деревень.
Архитектурным центром монастыря является Никольский собор, строительство которого датируется концом XII — началом XIII века. Собор неоднократно подвергался реконструкциям и восстановительным работам. В 1668 году, после разрушений, нанесенных шведскими войсками в период Смутного времени, собор был восстановлен и освящен.
В 1692 году на территории монастыря была возведена каменная восьмигранная колокольня с шатровым деревянным верхом, построенная тихвинскими мастерами. Колокольня соединяла соборную церковь и трапезную, образуя единый архитектурный ансамбль.
В 1714 году монастырь был подчинен Александро-Невскому монастырю, однако в 1811 году, по Высочайшему соизволению, обрел самостоятельность в качестве заштатного монастыря. В период с 1860 по 1873 годы, по проекту архитектора Алексея Максимовича Горностаева, на месте ветхого храма XVII века была построена церковь святителя Иоанна Златоуста. Храм выполнен в стиле древней базилики и украшен живописью с сюжетами из жития святого Иоанна Златоуста.
В 1927 году монастырь был официально закрыт, однако монашеская община продолжала существовать до 1937 года в виде рыболовецкой артели. В последующие годы на территории обители размещались различные светские учреждения, включая машинно-тракторную станцию и ремесленную школу.
