Собор Живоначальной Троицы в Раифском Богородицком монастыре был возведён в начале XX века в русском стиле. Строительство велось с 1904 по 1910 год на территории монастыря, основанного в XVII столетии. Монастырь получил название в память о древней Раифской обители у Красного моря, где в IV веке были убиты монахи-отшельники.
В советский период, в 1930 году, монастырь был закрыт. Троицкий собор, как и другие храмы обители, подвергся разорению. Помещения использовались в хозяйственных целях, а позднее — в качестве тюрьмы для политзаключённых. В годы Великой Отечественной войны на территории располагался лагерь для военнопленных.
В 1991 году монастырский комплекс был возвращён Русской Православной Церкви. Начались восстановительные работы. Троицкий собор был отреставрирован одним из первых. Архитектурный облик здания сохранил характерные черты русского стиля: пятиглавое завершение, кокошники, декоративные аркатурные пояса, узорчатые наличники.
В интерьере собора восстановлен иконостас с иконами, выполненными в традициях древнерусской живописи. Настенные росписи воссозданы по сохранившимся фрагментам и архивным фотографиям. В храме находятся почитаемые образы, в том числе список с чудотворной Грузинской иконы Божией Матери.
Богослужебная жизнь в соборе возобновилась в середине 1990-х годов. Собор является главным храмом монастыря, где совершаются праздничные и воскресные богослужения. При соборе действует воскресная школа для детей и взрослых.