Храм Архангела Михаила в Раифском Богородицком монастыре является надвратным храмом, расположенным в колокольне монастырского комплекса. Строительство колокольни с храмом началось в 1889 году на средства казанского купца Михаила Тимофеевича Атлашкина. По преданию, решение о строительстве было принято после того, как настоятель монастыря получил благословение от случайно встреченной девочки. Основные строительные работы завершились к 1891 году, когда на колокольню был поднят крест. Окончательное освящение храма во имя Архангела Михаила состоялось в 1903 году.
Архитектурный облик колокольни с храмом выполнен в русском стиле с элементами эклектики. Высота сооружения составляет около 60 метров, что делает его самым высоким строением монастырского ансамбля. Храм расположен в ярусе звона колокольни, что является традиционным решением для надвратных церквей православных монастырей. В 1905 году на колокольню был поднят 5-тонный колокол, отлитый по специальному заказу в Донецке.
В советский период, после закрытия монастыря в 1918 году, колокольня с храмом использовалась в хозяйственных целях. В 1930-х годах на территории монастыря размещалась тюрьма для политзаключенных, а позднее - колония для несовершеннолетних. Колокольня лишилась своих колоколов, а внутренние помещения были переоборудованы. Возрождение храма началось в 1990-х годах после возвращения монастыря Русской Православной Церкви. В 2004 году были завершены основные работы по восстановлению надвратного храма, а 21 ноября того же года в нем состоялся первый молебен.
Архитектурной особенностью храма является его расположение в колокольне, что определяет компактные размеры помещения. Иконостас храма выполнен в традициях русского церковного искусства конца XIX - начала XX века. В храме сохранились элементы первоначального убранства, включая фрагменты росписей и резные детали. Колокольня с храмом Архангела Михаила является важной частью монастырского ансамбля, формируя его силуэт и завершая перспективу главного подхода к монастырю.