Строительство первой деревянной церкви в честь Трёх Святителей началось в 1849 году и завершилось в 1856 году. В этом же году храм был освящён, что способствовало приобретению поселением статуса села. Инициаторами возведения храма были местные зажиточные купцы, стремившиеся обеспечить население местом для отправления религиозных обрядов.
В 1855 году, ещё до завершения строительства, к храму был назначен первый священник — 25-летний Афанасий Иванович Сахарсов, выпускник Калужской духовной семинарии. Он был рукоположен во священника 20 ноября 1855 года епископом Томским и Енисейским Парфением.
Архитектурно храм представлял собой деревянное здание, характерное для сибирских церквей того времени. Он располагался на главной площади села.
В 1936 году, в период антирелигиозной политики советского государства, храм был разрушен. На его месте остались лишь несколько могил священнослужителей и вековые деревья, напоминающие о прежнем духовном центре села.
После распада СССР и изменения государственной политики в отношении религии, в 1995 году в Ермаковском был зарегистрирован православный приход храма Трёх Святителей Великих. Поначалу богослужения проводились в доме священника, построенном ещё до революции. В июле 2005 года была заложена новая церковь, строительство которой стало возможным благодаря усилиям прихожан и местных властей.