Строительство храма началось в 1995 году и завершилось в 2008 году. Проект был разработан московским архитектором Дмитрием Щепетковым. Инициатива возведения храма принадлежала группе единомышленников, включая архитектора и его знакомых, а также местных жителей. Основной целью строительства было воссоздание классического процесса постройки деревянного храма, что было успешно реализовано.
Храм освящён 5 мая 2008 года в канун 500-летия преставления преподобного Нила Сорского. Каноническое название — храм во имя преподобного Нила Сорского.
Архитектурно храм представляет собой восьмерик на четверике с шатровым завершением, характерным для деревянного зодчества Русского Севера. Здание выполнено из дерева, с сохранением традиционных технологий и приёмов строительства. Фасады храма украшены резными деталями, подчёркивающими его принадлежность к северной архитектурной традиции.
Храм расположен в непосредственной близости от Ферапонтова Белозерского Богородице-Рождественского монастыря, одного из древнейших монастырей Русского Севера, основанного в XIV веке. Монастырь является памятником истории и культуры федерального значения и включён в список Всемирного наследия ЮНЕСКО.