Первые упоминания о храме в Скоблеве датируются 1630 годом, когда в селе уже существовала церковь, посвящённая святителю Николаю Чудотворцу. В 1700 году была возведена новая церковь на месте прежней. В 1721 году местный помещик, казначей монетных дворов Иван Дмитриевич Алмазов инициировал строительство очередного храма, который был освящён в 1727 году также во имя святого Николая Чудотворца.
В 1792 году на месте предыдущих деревянных сооружений была построена каменная церковь с трапезной и колокольней, завершённой шпилем. В трапезной части храма были устроены два придела: во имя святых Адриана и Наталии, а также в честь преподобного Сергия Радонежского.
В период советской власти, не позднее 1930-х годов, храм был закрыт, а его здание использовалось в хозяйственных целях. В результате длительного запустения и вандализма церковь пришла в аварийное состояние. В 1997 году здание храма было возвращено Русской Православной Церкви, после чего начались работы по его восстановлению.