Никитский приход в одноимённой слободе на западной окраине средневекового Ярославля возник не позднее XV века. Слобода с таким названием впервые упоминается в грамоте великого князя Василия III от 1511 года. В приходе изначально существовали два небольших храма с приделами, посвящёнными святому великомученику Никите. В 1647 году была построена одноглавая кирпичная церковь, освящённая во имя Архангела Михаила, но продолжавшая называться по имени придела в честь Никиты Мученика. В конце XVII века рядом с храмом была возведена ярусная колокольня, отличающаяся своей стройностью и высотой.
В 1670 году была построена тёплая Сретенская церковь с алтарным приделом Успения Богоматери. К концу XIX века этот храм обветшал и стал недостаточным для растущего прихода. В 1900–1903 годах летний храм был значительно расширен, перестроен и освящён в честь святого великомученика Никиты.
В 1929 году по решению городских властей Никитский приход был ликвидирован, а холодная церковь предназначена к сносу. Сотрудники Ярославской реставрационной мастерской перед разборкой провели частичную фиксацию памятника: была составлена иконография стенописей, зарисовано расположение клейм иконостаса, сняты живописные композиции общей площадью около 10 кв. м. Летнюю церковь Михаила Архангела разобрали в 1929 году, а тёплый храм лишился главы. Колокольня, благодаря своей высоте и значимости, была сохранена и использовалась в качестве геодезической точки.
В 1997 году тёплая Сретенская церковь и колокольня Никитского прихода были возвращены Русской Православной Церкви. Оба здания находились в тяжёлом состоянии, однако 28 сентября того же года состоялась первая служба. К 2006 году были восстановлены фронтоны, крыша и барабан храма, что вернуло ему первоначальный внешний облик. В 2008 году был освящён крест на новой главе. Восстановительные работы продолжаются, включая реставрацию пристройки к южной стене храма.
