Храм Николая Чудотворца, известный также как церковь Николы Мокрого, был возведен в 1665-1672 годах на средства купцов Афанасия Лузина и Андрея Лемина, а также посадских людей Федора Выморова и Степана Тарабаева. Храм построен на месте прежнего деревянного, в традициях ярославской школы зодчества XVII века. Главный престол освящен в честь святителя Николая Мирликийского, боковые приделы - во имя великомученицы Варвары и святителя Алексия, митрополита Московского.
Архитектурный ансамбль включает холодный пятиглавый храм и теплую одноглавую церковь Тихвинской иконы Божией Матери, построенную в 1686 году. Характерными элементами являются закрытая одноэтажная галерея, шатровые объемы приделов и колокольни, а также обильное декорирование полихромными изразцами в конце XVII века. Алтарные окна были украшены изразцовыми наличниками, а западные фасады получили шатровые притворы с керамическим декором.
Росписи храма выполнены в 1673-1674 годах артелью ярославских мастеров, включавшей Логина Сидорова, Ермолая Федорова и других. Программа росписи включает 660 сюжетных клейм, посвященных житию и чудесам Николая Чудотворца, изображения вселенских соборов, Страшного суда и других библейских сцен. В XIX веке живопись дважды поновлялась - в 1853 и 1895-1896 годах.
В храме находились ценные предметы церковного убранства, включая медные паникадила голландской работы, резные моленные места середины XVII века, предназначавшиеся для царя Алексея Михайловича и патриарха Никона, а также кованую решетку паперти с цветочными мотивами. Часть этих предметов впоследствии была перенесена в другие храмы Ярославля.
В советский период храм продолжал функционировать, что способствовало сохранению его архитектурного и художественного наследия. В 1970-1980-х годах проводились реставрационные работы по сохранению стенописи в приделах. В настоящее время храм остается действующим и представляет собой значительный памятник ярославской школы церковного зодчества и монументальной живописи второй половины XVII века.