Первое здание для походного храма в селе Паспаул было сооружено в 1865 году. Это был двухэтажный дом размером 10 на 8 аршинов, где верхний этаж занимал храм, а нижний - кельи для миссионера. Инициатива строительства исходила от новокрещеного зайсана Василия Карпова (Уйгучакова), выразившего соответствующее пожелание еще в 1859 году. Данное молитвенное строение было уничтожено пожаром в 1889 году.
Новый храм в честь Казанской иконы Божией Матери возвели в 1891 году на средства зайсана Кондомской волости Михаила Васильевича Тобокова и местных жителей. Закладка здания произошла в 1889 году, а освящение совершено по благословению епископа Томского и Семипалатинского Макария (Невского) улалинским миссионером Виктором Россовым. В 1906 году произведена замена обветшавших элементов кровли, глав и крестов. Металлическое покрытие крыши устроено на пожертвования местных благотворителей. После устройства нового престола храм повторно освящен 21 октября 1907 года настоятелем, миссионером священником Николаем Шарковым по благословению епископа Бийского Иннокентия (Соколова).
В 1914 году заложен более просторный храм, строительство которого завершилось в 1915 году. Финансирование осуществлялось за счет средств прихожан и благотворителей. Освящение совершено 11 августа 1915 года епископом Бийским Иннокентием (Соколовым). В 1931 году священнику Николаю Шаркову запретили совершать богослужения, после чего последовал его арест. Храм окончательно закрыт в 1935 году, а в 1970-х годах здание перестроено под сельский клуб.
В 1995 году начаты работы по восстановлению храма. В 1996 году завершена реставрация, и храм освящен архиереем. Приход Казанской иконы Божией Матери в селе Паспаул имеет статус исторического миссионерского стана Алтайской Духовной Миссии, основанного в 1861 году протоиереем Стефаном Ландышевым. Сохранились сведения, что к данному миссионерскому стану в 1902 году относилось три христианских селения и двенадцать заимок.