Село Чоя было основано в 1876 году переселенцами из различных губерний Российской империи. Благодаря удачному расположению на Бийском торговом тракте, село быстро развивалось и стало купеческим центром. В начале XX века в селе была построена деревянная церковь в честь Успения Пресвятой Богородицы, которая служила духовным центром для местных жителей. Однако в конце 1930-х годов, в период антирелигиозной политики Советского Союза, храм был разобран, и его место оставалось пустующим на протяжении нескольких десятилетий.
В 1999 году в селе Чоя была зарегистрирована православная община, что стало первым шагом к возрождению церковной жизни в регионе. В 2003 году, по благословению Преосвященного Максима, епископа Барнаульского и Алтайского, началось строительство нового каменного храма на месте прежней деревянной церкви. Строительство велось на пожертвования прихожан и при поддержке местной администрации. Первоначально богослужения проводились в молельном доме, расположенном рядом со строящимся храмом.
28 августа 2006 года, в день празднования Успения Пресвятой Богородицы, в строящемся храме была отслужена первая Божественная литургия. К этому времени основные строительные работы были завершены, однако внутреннее убранство храма продолжало дополняться и совершенствоваться в последующие годы. Архитектурно храм представляет собой каменное здание с традиционными для православных церквей элементами: куполом, колокольней и крестами. Внутреннее пространство храма оформлено в соответствии с канонами Русской Православной Церкви, включая иконостас и другие элементы церковного убранства.
