Храм святителей Германа Казанского и Митрофана Воронежского был сооружен в 1799 году при братском корпусе Свияжского Богородице-Успенского мужского монастыря. Освящение состоялось в декабре того же года. Храм являлся однопрестольным, трехапсидным, с купольным завершением. В архитектуре прослеживались элементы барокко, сохранившиеся в наличниках окон.
В середине XIX века храм подвергся значительной перестройке. На средства благотворительницы Саврасовой были выполнены росписи интерьера и установлен новый трехъярусный иконостас. В начале XX века храм вновь был обновлен, однако вскоре после этого разобран. Сохранились лишь фрагменты первоначального декора, включая барочные оконные наличники.
Храм располагался в северной части монастырского комплекса. К его фасаду вели две наружные каменные лестницы с крыльцами, обеспечивавшие вход непосредственно со двора на второй этаж. Эти архитектурные элементы были утрачены, как и первоначальная планировка оконных проемов.
В 1930-х годах здание храма подверглось капитальной перестройке, после чего было заброшено. К началу XXI века сохранились только стены без перекрытий. В 2010-2012 годах проведены реставрационные работы, восстановившие исторический облик храма в рамках монастырского ансамбля.
Свияжский Богородице-Успенский монастырь, в состав которого входит храм, был основан в 1555 году. Монастырь играл значительную роль в распространении православия в Казанском крае. Архитектурный ансамбль монастыря включает памятники XVI-XIX веков, среди которых Успенский собор и Никольская трапезная церковь.
