Деревня Аверкиево известна с середины XVII века и находится примерно в 13 км к югу от центра города Павловский Посад Московской области. До начала XX века в деревне не было собственного храма, и жители посещали ближайшие церкви в селах Загарье и Чижи. В 1910 году местные крестьяне обратились с ходатайством о строительстве каменного храма и образовании самостоятельного прихода. Инициатором строительства выступил землевладелец и общественный деятель Александр Дмитриевич Самарин, который взял на себя основные расходы по возведению храма и домов причта.
Проект храма был разработан архитектором Василием Николаевичем Башкировым в духе церковной архитектуры XVII века. Башкиров, уроженец Вятки и ученик Московского училища живописи, ваяния и зодчества, сотрудничал с художником Виктором Михайловичем Васнецовым и стал одним из основоположников неорусского стиля в архитектуре.
Строительство храма началось в 1911 году и завершилось в 1914 году. Фасады колокольни и стен храма украшали майоликовые панно и керамические изразцы, выполненные по эскизам Михаила Врубеля. Внутреннее убранство храма и храмовая утварь были изготовлены в Абрамцевских мастерских, основанных семьей Мамонтовых, с которой Самарин был тесно связан. Орнаментальные работы иконостаса были выполнены по эскизам художника Андрея Саввича Мамонтова.
В 1915 году главный престол храма был освящён во имя Святой Живоначальной Троицы, а два других — во имя святого благоверного князя Александра Невского и святителя Николая Чудотворца. Освящение проводил благочинный Богородского уезда протоиерей Константин Голубев, впоследствии причисленный к лику святых как священномученик.
После революции 1917 года храм подвергся разрушениям. В 1930-х годах началось его разрушение: сжигались богослужебные книги и иконы, разворовывалась церковная утварь, разрушались стены и сбрасывались купола. Здание использовалось как склад для удобрений и ядохимикатов.
В 1994 году храм был возвращён Русской Православной Церкви в руинированном состоянии. Сельская община начала восстановительные работы, стремясь вернуть храму его первоначальный облик. Несмотря на частичные разрушения, сохранились майоликовые иконы и изразцы, украшавшие храм. В настоящее время в храме совершаются богослужения, и продолжаются работы по его восстановлению.
