Село Губино впервые упоминается в писцовых книгах Коломенского уезда за 1577–1578 годы. В середине XVIII века владельцем села была вдова капитанши Анастасия Алексеевна Квашнина, представительница древнего дворянского рода Квашниных. В 1767 году, во время межевания её владений, в Губине ещё не было церкви. Строительство каменного храма в честь Покрова Пресвятой Богородицы было завершено в 1778 году на средства Анастасии Алексеевны.
Архитектурно храм выполнен в стиле русского барокко и представляет собой кирпичное здание типа «восьмерик на четверике» с двусветным четвериком и двухъярусной шатровой колокольней. Помимо главного Покровского престола, в храме имелся придел во имя святой великомученицы Екатерины.
К концу XIX века приход Покровского храма включал село Губино и две деревни — Ратчино и Суханово, насчитывая в общей сложности 1066 жителей. В 1923 году, в условиях сложной экономической ситуации, приходы Губина и соседнего села Афанасьево были объединены по решению Московского епархиального управления.
В 1930-х годах храм был закрыт, а в 1960-х годах трапезная и алтарная части здания были разрушены. Впоследствии, в результате расширения Афанасьевского карьера цементного сырья, село Губино прекратило своё существование. В 1998 году полуразрушенный храм был передан верующим, однако восстановительные работы не были начаты, и здание продолжает находиться в аварийном состоянии.
