В середине XVIII века село Губино, к которому относилось Ратчино, принадлежало вдове капитанши Анастасии Алексеевны Квашниной. В 1767 году, во время проведения генерального межевания, в Губино ещё не было церкви. Однако уже в 1776 году была выдана храмозданная грамота на строительство храма, и к 1778 году церковь Покрова Пресвятой Богородицы была возведена.
Архитектурно храм выполнен в стиле русского барокко, характерного для 1730–1740-х годов. Церковь представляет собой кирпичное сооружение типа «восьмерик на четверике» с двусветным основанием и двухъярусной шатровой колокольней. Помимо главного престола в честь Покрова Пресвятой Богородицы, в храме имелся придел во имя великомученицы Екатерины.
К концу XIX века Губинский приход, к которому относилось Ратчино, включал 99 православных дворов и 17 старообрядческих. Общее число жителей составляло 1066 человек. В приход, помимо Губино, входили деревни Ратчино и Суханово. В Суханово ранее существовала своя церковь во имя Николая Угодника, которая со временем обветшала и исчезла; на её месте ныне находится небольшое кладбище.
В 1923 году приходы сёл Губино и Афанасьево приняли решение об объединении, чтобы совместно противостоять надвигающимся трудностям. Однако в 1930-х годах храм был закрыт, а в 1960-е годы трапезная и алтарь были разрушены. Впоследствии село Губино прекратило своё существование, и на его месте осталась полуразрушенная церковь.
В 1998 году церковь была передана верующим, но к настоящему времени она находится в полуразрушенном состоянии. В 2000-х годах территория, на которой располагается храм, была административно отнесена к деревне Ратчино.
