Село Лайково, ранее известное как Мелтихино или Богородское, упоминается в исторических документах с XVI века. В 1627 году, согласно писцовой книге, село находилось во владении князя Юрия Дмитриевича Хворостинина. Его сын, князь Федор Юрьевич Хворостинин, известный своей военной службой при царе Алексее Михайловиче, в 1646 году инициировал строительство деревянной церкви во имя Казанской иконы Божией Матери с приделом святых благоверных князей Феодора, Давида и Константина Ярославских чудотворцев. Эта церковь стала духовным центром села и укрепила его религиозные традиции.
В 1761–1764 годах, по инициативе владелицы села А.А. Нарышкиной, на месте деревянного храма была построена кирпичная церковь в стиле барокко. Здание представляло собой двенадцатигранную ротонду с центральным престолом в честь Казанской иконы Божией Матери. Внутреннее убранство храма было украшено иконами, написанными на Святой горе Афон, включая образ Казанской Божией Матери и святителя Пантелеимона.
В 1903 году архитектор Николай Николаевич Благовещенский спроектировал и построил к храму трапезную и колокольню, что значительно расширило и украсило церковный комплекс. Колокольня и трапезная были выполнены в гармоничном архитектурном стиле, соответствующем основному зданию храма.
После революции 1917 года церковь, как и многие другие, испытала трудные времена. В 1930-х годах храм был закрыт, его имущество разграблено, а здание использовалось под хозяйственные нужды и постепенно приходило в запустение. В годы Великой Отечественной войны и послевоенный период церковь не функционировала, и ее состояние продолжало ухудшаться.
В 1993 году, благодаря усилиям местных жителей и поддержке церковных властей, храм был возвращен верующим. В период с 1993 по 1998 годы была проведена реставрация здания: восстановлены утраченные элементы, проведены работы по укреплению конструкции и обновлению внутреннего убранства. В 1998 году храму была возвращена Казанская икона Божией Матери, сохраненная жителями села, что стало значимым событием для общины.
18 мая 2002 года, после завершения росписи интерьера, состоялось торжественное освящение храма. В этом важном событии приняли участие архиепископ Можайский Григорий, секретарь Московской епархии протоиерей Александр Ганаба и благочинный Одинцовского округа архимандрит Нестор Жиляев. Освящение проводилось по благословению Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия II.
