Первое документальное упоминание о церкви в Усово относится к 1627 году, когда в селе значилась деревянная церковь Спаса Нерукотворного Образа с приделами. В 1705 году, после пожара 1702 года, была построена новая деревянная церковь. В 1760-х годах, по инициативе Михаила Матюшкина, на месте деревянной церкви возвели каменный храм.
В 1867 году император Александр II приобрёл село Усово для своей супруги, императрицы Марии Александровны. В этот период усадьба была переоборудована, а церковь отремонтирована.
В 1882 году имение перешло к великому князю Сергею Александровичу и его супруге, великой княгине Елизавете Фёдоровне. Они уделяли значительное внимание усовскому храму, способствуя его благоустройству.
После революции 1917 года усадьба Усово была преобразована в дом отдыха, а Спасский храм закрыт в 1932 году. В 1940 году с храма сняли колокола и верхний купол, перестроив здание под дачу.
В 2004 году храм был отреставрирован с элементами реконструкции и ныне находится на территории резиденции Президента РФ Ново-Огарёво.
В 2009–2010 годах, при поддержке председателя правительства РФ В.В. Путина, в селе Усово был построен новый Спасский храм. Современный храмовый комплекс, созданный по проекту архитектора В.Н. Ижикова, включает церковь, Водосвятную часовню, Дом причта и Православный просветительский центр «Усово-Спасское». Центром комплекса является четырёхпрестольный храм с крестильней во имя Спаса Нерукотворного Образа, внешне напоминающий церкви XI века.