Село Ильинское впервые упоминается в духовной грамоте великого князя Ивана Даниловича Калиты в 1339 году. Изначально оно называлось Скульнев стан, однако после строительства здесь церкви во имя пророка Илии получило современное название. В писцовых книгах 1577–1578 годов село записано как старая вотчина Алексеевского девичьего монастыря в Москве. В период Смутного времени Ильинское было разорено, что отразилось на состоянии местной церкви.
В XVII веке на месте разрушенного храма была возведена новая деревянная церковь. Однако со временем она обветшала, и в 1732 году по инициативе боярина Василия Ивановича Стрешнева было принято решение о строительстве каменного храма. Проект был разработан русским зодчим А.П. Евлашевым, и храм был выполнен в стиле русского барокко.
Дошедшая до нашего времени Ильинская церковь с Никольским приделом была построена из белого камня и кирпича на пожертвования прихожан в период с 1819 по 1829 годы. Храм представляет собой бесстолпное двусветное сооружение с изящной главкой. Придел во имя святителя Николая отделялся от основной церкви каменной стеной с аркой для стеклянных дверей. Алтарь основной церкви также был отделен каменной стеной. Иконостас в основной церкви имел четыре яруса, а в приделе — три. В 1838 году началось сооружение колокольни, объединенной с церковью притвором.
Архитектурно храм сочетает элементы барокко и классицизма. Основной объем представляет собой двусветный четверик с полукруглой апсидой. Фасады украшены пилястрами и декоративными элементами, характерными для русского барокко. Колокольня трехъярусная, завершена шпилем, что придает зданию вертикальную устремленность и торжественность.
В советский период храм, как и многие религиозные сооружения, подвергся закрытию и использовался не по назначению. Однако благодаря усилиям местных жителей и верующих в постсоветское время начались работы по восстановлению храма. Были проведены реставрационные работы, восстановлены утраченные элементы декора и внутреннего убранства.
В настоящее время Ильинский храм является действующим и продолжает служить духовным центром для жителей села Ильинское и окрестностей. При храме ведется активная приходская жизнь, проводятся богослужения, организуются мероприятия для детей и молодежи, направленные на духовное и культурное просвещение.