Приход был основан 15 декабря 1989 года, что ознаменовало начало активной деятельности по возрождению православной жизни в этом районе.
Строительство деревянного храма началось вскоре после основания прихода, и уже в Вербное воскресенье 1991 года состоялось его освящение. 14 мая 1991 года храм посетил Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II в ходе своего первого визита в Новосибирск. Патриарх благословил планы прихода в области духовно-просветительского и социально-благотворительного служения.
В 1992 году при приходе была учреждена Православная гимназия во имя преподобного Сергия Радонежского, что стало важным шагом в развитии религиозного образования в регионе. В 1993 году создано сестричество во имя преподобномученицы Елисаветы, под эгидой которого при храме был построен Дом милосердия; освящение закладного камня состоялось в 2003 году.
Архитектурно храм представляет собой деревянное здание с простой архитектурой, щипцовыми завершениями фасадов и декоративным пятиглавием. Он является одной из первых построенных в Новосибирске церквей после периода гонений на церковь.
В 2003 году при храме началось строительство Дома милосердия во имя святых Марфы и Марии, предназначенного для социальной и благотворительной деятельности. Впоследствии при храме были организованы курсы по подготовке сестер милосердия, а также различные образовательные и социальные проекты.
В настоящее время храм продолжает свою деятельность, являясь центром духовной жизни для жителей Академгородка и Новосибирска. Богослужения проводятся регулярно, в том числе две литургии по воскресным дням: ранняя в 7:30 и поздняя в 9:30 часов. В субботние дни литургия совершается в 9:00 часов, по окончании которой проводится панихида и заочное отпевание усопших. Вечерние богослужения начинаются в 17:00.
