Село Началово было основано астраханским губернатором Н.А. Бекетовым. Первоначально в селе существовал деревянный храм во имя святого Георгия Победоносца, перенесенный в 1771 году с Троицкого (Бурунтаевского) бугра. Однако этот храм оказался недостаточно вместительным для растущего населения, и в ноябре 1772 года была подана челобитная о разрешении постройки нового, более просторного каменного храма. Строительство началось не позднее 1773 года и завершилось к 1780 году. По неизвестным причинам освящение храма состоялось лишь 16 июля 1794 года, во время погребения Н.А. Бекетова; храм был освящен в честь иконы Божией Матери «Рудненская», которой Бекетова в свое время благословила императрица Елизавета Петровна.
В 1874 году, вместо ветхой колокольни, расположенной в среднем куполе храма, была пристроена отдельная каменная колокольня, а также установлен новый иконостас. Изначально храм имел два престола: главный — во имя Рудненской иконы Божией Матери, и северный — во имя великомученика Георгия Победоносца. В 1887 году был построен и 4 октября освящен южный придел во имя святого благоверного князя Александра Невского.
Архитектурно храм представлял собой большое двухэтажное здание, выполненное в неовизантийском стиле. По фасаду церкви, в нишах, стояли алебастровые фигуры апостолов. На фасаде также были установлены самодействующие боевые часы, утраченные в результате пожара 1848 года. Внутреннее убранство храма отличалось богатством: под куполом находилась роспись, изображавшая деву с огненными крыльями, сидящую на золоченом престоле и держащую в руках посох; центральный деревянный иконостас был украшен резными золочеными плодами и виноградными гроздьями.
С храмом связано имя полководца А.В. Суворова, который проживал в селе Началово в 1780–1782 годах во время подготовки к походу на Персию. Суворов исполнял при церкви послушание — был чтецом и пел на клиросе. В левом приделе храма была установлена мемориальная бронзовая доска с надписью: «Здесь был и пел А.В. Суворов в 1781–1782 годах». В этом храме Суворов, после семейной размолвки, мирился с женой, совершая обряд возобновления брака.
В 1935 году храм был разрушен. Последним священником до этого времени был иерей Григорий Хлебунов, обвиненный в подстрекательстве к кулацкому мятежу в феврале 1930 года и вскоре расстрелянный. В 2004 году священномученик Григорий Хлебунов был причислен к лику святых в Соборе новомучеников и исповедников Российских XX века.
В конце XX века было принято решение о строительстве нового храма. В мае 1998 года открылся молельный дом. В 1999 году, недалеко от места, где ранее стоял разрушенный храм, был заложен первый камень нового здания и установлен крест. 23 мая 2005 года был совершён чин освящения нулевого цикла. В 2006 году состоялось освящение куполов, а в 2008 году — колоколов храма, отлитых в Волгодонске. В 2009 году был расписан иконостас. 4 апреля 2010 года, в праздник Пасхи, состоялось открытие храма.
