Храм Рождества Христова в Саратове был построен в 1896 году на средства жены машиниста паровозного депо Матрены Тимофеевны Макариновой при участии саратовского купца Чукалина и пожертвований железнодорожников. Церковь возведена в каменном исполнении с каменной колокольней, имела один престол в честь Рождества Христова. На колокольне были установлены часы.
В 1935 году храм был закрыт советской властью. На момент закрытия в штате причта состояли священник и диакон. Здание подверглось разграблению, сторож храма был убит. В последующие годы помещение использовалось под библиотеку №9, затем в нем размещалась областная поликлиника. С 1974 по 1999 годы в здании находился областной кожно-венерологический диспансер.
В августе 1992 года в здании произошел пожар. В 1993 году верующие собрали более 1000 подписей за возвращение храма Церкви. 16 октября 1999 года здание было передано Саратовской епархии. 7 января 2000 года в храме совершена первая Божественная литургия после возвращения.
С 1999 по 2016 год проводились реставрационные работы: разобрана старая кирпичная кладка, фермы перекрытий, восстановлен алтарь, устроены хоры для клироса. В 2011 году богослужения перенесены в основной алтарь. В 2015 году завершены работы по устройству крестильни и установке иконостаса.
19 ноября 2016 года митрополит Саратовский и Вольский Лонгин совершил Великое освящение храма. 28 декабря 2020 года храму присвоен статус Архиерейского подворья. В настоящее время храм имеет два престола: главный - в честь Рождества Христова и приставной - в честь Благовещения Пресвятой Богородицы.
