Строительство храма было начато в 2004 году и завершено в 2010 году.25 июля 2010 года архиепископ Петрозаводский и Карельский Мануил совершил чин Великого освящения церкви.
Посвящение храма преподобному Ионе Яшезерскому обусловлено его исторической связью с данной местностью. Преподобный Иона, вепс по национальности, родился в селе Шокша, расположенном вблизи посёлка Кварцитный. В XVI веке он основал Благовещенский Ионо-Яшезерский мужской монастырь на берегу озера Яшезеро, где вёл подвижническую жизнь.
Архитектурно храм представляет собой деревянное здание, выполненное в традициях русского деревянного зодчества. Т-образный в плане храм украшен резьбой; четверик с гранёным прирубом алтаря надстроен увенчанной главкой мансардой, расширенная трапезная завершена ярусом звона. В окнах установлены витражи, выполненные петрозаводским мастером по старинной средневековой технологии.