Храм Преображения Господня в Вепсской национальной волости Карелии связан с историей Благовещенского Ионо-Яшезерского монастыря, основанного в XVI веке. Монастырь был учрежден преподобным Ионой Яшезерским, учеником преподобного Александра Свирского. Первоначально на территории обители была возведена деревянная церковь в честь Благовещения Пресвятой Богородицы, а позднее, в 1628–1629 годах, построен храм Преображения Господня. Средства на его возведение были пожертвованы царственными особами, включая царицу Марфу Ивановну и царей Федора Ивановича и Василия Шуйского.
Монастырь, включая Преображенский храм, неоднократно перестраивался и обновлялся. В 1725 году обитель была приписана к Клименецкому монастырю, а в 1734 году — к Александро-Свирскому. В XVIII–XIX веках монастырь владел землями, лесными угодьями и двумя озерами, а братия занималась хлебопашеством, скотоводством и огородничеством. В 1918 году монастырь был закрыт, а последние насельники расстреляны. В советский период на его территории размещались исправительные учреждения и лесозаготовительные предприятия, что привело к значительным разрушениям.
К началу XXI века от монастырского комплекса сохранились лишь фрагменты: стены каменного храма Преображения Господня, часть ограды из шокшинского кварцита и остатки нескольких зданий. В 2004 году в селе Шелтозеро, административном центре Вепсской волости, было организовано подворье монастыря, где началось возрождение церковной жизни. В 2012 году здесь был заложен новый храм в честь Рождества Христова, однако сам Преображенский храм в Яшезерской обители остается в аварийном состоянии.
Архитектурные особенности первоначального Преображенского храма точно не установлены из-за недостатка сохранившихся описаний. Известно, что он был деревянным, с трапезной частью, иконостасом и колокольней. В синодиках монастыря упоминаются иконы и церковная утварь, пожертвованные вкладчиками, включая печатные и рукописные книги. В настоящее время предпринимаются попытки восстановления исторического наследия монастыря, включая исследование архивных материалов и организацию паломнических поездок к месту его расположения.