Для возведения храма использовался лес из деревни Анновка, где предварительно был изготовлен сруб, который затем перевезли и собрали в Кяхте.Среди строителей упоминается печник Иван Роднов.Вокруг церкви установили железную ограду с шарами на столбах.
В период советской власти многие храмы подверглись закрытию и разрушению, однако конкретные сведения о судьбе Покровской церкви в Кяхте в этот период отсутствуют. Предположительно, храм был закрыт, а здание использовалось в иных целях или разрушено, как это происходило со многими религиозными сооружениями того времени.
В постсоветский период началось возрождение религиозной жизни в России. В Шигонском районе были восстановлены и построены новые храмы. В частности, в селе Шигоны был восстановлен храм Архангела Михаила, а в других населенных пунктах района также возводились церкви.