История храмов, посвящённых апостолам Петру и Павлу в Лодейном Поле, восходит к началу XVIII века. В 1702 году на берегу реки Свирь была построена первая деревянная церковь в честь этих святых, связанная с деятельностью Олонецкой верфи, основанной Петром I. В 1766 году эта церковь была разобрана и перенесена на другое место, однако впоследствии сгорела. В 1843 году на её месте был возведён новый каменный трёхпрестольный собор во имя святых апостолов Петра и Павла в стиле позднего классицизма. В 1875 году этот собор получил статус кафедрального. В советский период, в 1932 году, собор был закрыт, а в годы Великой Отечественной войны серьёзно пострадал от артиллерийских обстрелов. Впоследствии его руины были разобраны.
В 1989 году в Лодейном Поле была образована православная община. Богослужения initially проводились в переоборудованном жилом доме, переданном на нужды прихода местной жительницей. В начале 1990 года митрополит Ленинградский и Новгородский Алексий направил в Лодейное Поле священника Михаила Николаева, который инициировал строительство нового храма. В 1992 году отец Михаил был назначен настоятелем новостроящегося храма во имя святых первоверховных апостолов Петра и Павла. Помощь в оборудовании храма оказали православные общины Бельгии и Нидерландов.
Строительство нового храма велось в период с 1990 по 1998 годы по проекту архитектора А.А. Родькина. Здание было возведено недалеко от места расположения прежнего собора на берегу реки Свирь. 4 января 1998 года храм возвестил о своём завершении колокольным звоном. 26 июля 1998 года состоялось освящение иконостаса, в котором новописанные иконы были вставлены в старинный каркас, найденный в подвале Важинской церкви в Подпорожском районе. 1 июля 2001 года митрополит Санкт-Петербургский и Ладожский Владимир совершил великое освящение храма и отслужил первую Божественную литургию на новоосвящённом престоле.
Архитектурно храм представляет собой деревянное здание, выполненное в традициях русского деревянного зодчества. Внешний облик храма характеризуется яркой окраской и гармоничными пропорциями, что делает его заметным архитектурным акцентом в городской среде. Внутреннее убранство храма включает иконостас, воссозданный с использованием старинного каркаса и новописанных икон.
В непосредственной близости от храма построена часовня, посвящённая иконе Божией Матери «Живоносный источник», в которой находится колодец, используемый для освящения воды в храме. При храме действует воскресная школа для детей и взрослых, способствующая духовному просвещению и воспитанию прихожан.
