Этот храм имеет значительную историю, связанную с возрождением православной общины в регионе после длительного перерыва в богослужебной деятельности.
После периода, когда богослужения в Лодейном Поле не проводились более 50 лет, в 1989 году была зарегистрирована православная община. Инициатором создания общины стала местная жительница Варвара Фёдоровна Яхно, которая пожертвовала свой жилой дом для организации молитвенного дома. После реконструкции здание было преобразовано в храм, освящённый в честь святой великомученицы Варвары, небесной покровительницы жертвовательницы. Варвара Фёдоровна проживала при храме в специально построенной келье и скончалась в 1996 году, будучи похороненной у алтаря новопостроенного храма святых апостолов Петра и Павла.
Архитектурно здание храма представляет собой реконструированный жилой дом, адаптированный для проведения богослужений. В ходе переоборудования были внесены изменения, соответствующие канонам православной архитектуры, включая обустройство алтарной части и пространства для прихожан. Внутреннее убранство храма было оформлено с учётом традиционных православных канонов.
В 2000 году храм был освящён малым чином, что ознаменовало завершение основных этапов его обустройства и начало регулярных богослужений. Престольный праздник храма отмечается 17 декабря, в день памяти святой великомученицы Варвары.