Первое упоминание о храме относится к 1789 году, когда была построена деревянная церковь во имя Положения ризы Пресвятой Богородицы во Влахерне. Однако в начале XVIII века эта церковь сгорела, и на ее месте была возведена новая, освященная 7 мая 1789 года игуменом Свято-Троицкого Алатырского монастыря Самуилом по благословению епископа Нижегородского и Алатырского Дамаскина. Из сгоревшей церкви удалось сохранить только образ Пресвятой Богородицы «Троеручица».
В 1872 году на средства потомственного почетного московского гражданина Ивана Прокопьевича Барсова была полностью перестроена теплая трапезная часть храма, и в 1875 году здесь был освящен придел во имя Трех Святителей: Василия Великого, Григория Богослова и Иоанна Златоуста.
В 1865 году село Мишуково охватила эпидемия холеры, от которой погибло множество жителей. По благословению священника жители собрались для проведения Божественной литургии и молебна перед иконой Божией Матери «Троеручица». После этого эпидемия прекратилась. В память об этом событии ежегодно совершались крестные ходы с чудотворным образом. С 25 июля 2006 года традиция крестных ходов была возобновлена.
В 1894 году на средства прихожан была построена новая деревянная церковь Святителя Николая Чудотворца, заменившая старую постройку 1789 года. Главный престол был освящен во имя Святителя Николая, а придел — во имя Трех Святителей. Церковь имела одну большую главу и четыре малых, а также трехъярусную колокольню.
В период с 1930 по 1932 годы, а также с 1940 по 1947 годы храм был закрыт и использовался в качестве зернохранилища. С 1947 года богослужения в храме возобновились и продолжаются по настоящее время.
Архитектурно церковь представляет собой деревянное здание с одной большой главой и четырьмя малыми, а также трехъярусной колокольней. Внутреннее убранство храма включает иконостас и иконы, обновленные в 1847 году. В 1876 году был устроен теплый придельный храм в честь святого Димитрия Мироточивого.
