Храм Казанской иконы Божией Матери в Зеленодольске был основан в 2003 году, когда владыкой Казанским и Татарстанским Анастасием было дано благословение на создание прихода святителя Николая Чудотворца и строительство храма в честь Казанской иконы Божией Матери. Деревянный храм заложен в мае 2006 года, строительство велось на средства верующих под руководством настоятеля прихода. С осени 2007 года в храме начали совершаться богослужения.
19 апреля 2008 года, в Лазареву субботу, архиепископ Казанский и Татарстанский Анастасий освятил храм в присутствии большого числа верующих. Храм стал значимым для жителей города, так как до его постройки верующие были вынуждены посещать Петропавловский храм в поселке Гари или храм св. ап. Андрея Первозванного (подворье Раифского Богородицкого монастыря).
Архитектурно храм выполнен в традициях деревянного зодчества с каскадной формой и шатровой кровлей, увенчанной серебристой главой. Центральный вход украшен малой главкой, а парадное крыльцо оформлено в русском стиле с резными колоннами и балюстрадой. Внутреннее убранство включает деревянную отделку с позолотой.
В августе 2010 года начались работы по возведению фундамента нового храма Казанской иконы Божией Матери. Первая Божественная литургия в новопостроенном храме состоялась 19 декабря 2015 года.
При храме действуют воскресная школа и библиотека. В 2018 году храм пострадал от пожара, который, по данным МЧС, мог быть умышленным. Подозреваемая в поджоге женщина была зафиксирована на камерах наблюдения.
