Приход святителя Николая Чудотворца в Зеленодольске был учрежден в 2003 году по благословению архиепископа Казанского и Татарстанского Анастасия. Первоначально планировалось строительство храма в честь Казанской иконы Божией Матери. В мае 2006 года состоялась закладка деревянного храма, строительство которого велось на средства прихожан под руководством настоятеля. Богослужения начались осенью 2007 года, а 19 апреля 2008 года храм был освящен в честь Казанской иконы Пресвятой Богородицы.
В августе 2010 года начались работы по возведению фундамента нового храма святителя Николая Чудотворца. Строительство столкнулось с трудностями, включая невыполнение обязательств поставщиками строительных материалов. Первая Божественная литургия в новом храме была совершена 19 декабря 2015 года. Храм построен в традиционном православном стиле, хотя точные данные об архитектурном решении отсутствуют.
При храме действует воскресная школа и библиотека. В ограде приходского комплекса находится церковь Казанской иконы Божией Матери, построенная ранее. Храм является центром духовной жизни города, где совершаются все положенные богослужения, включая таинства крещения, венчания и отпевания.
