Первое упоминание о храме относится к XVII — первой половине XVIII века, когда в документах зафиксирована деревянная церковь во имя святого пророка Илии с приделом во имя Василия Кесарийского, расположенная в Обояни на посаде в Казачьей слободе. В «Топографическом описании Курской губернии» 1784 года указано, что в этой слободе находилась деревянная церковь во имя святого пророка Илии, при которой имелось четыре двора священно- и церковнослужителей с двенадцатью душами. Приход состоял из однодворцев и малороссиян, живших своими дворами.
В 1841 году на месте старой деревянной церкви было возведено новое каменное здание храма. Строительство осуществлялось стараниями помещика Козельского уезда Калужской губернии Николая Алексеевича Домбровского при участии прихожан. Церковь имела в своём владении 54 десятины пахотной земли, 3 десятины сенокосной и 2 десятины 600 квадратных саженей усадебной с погостом. К 1915 году в слободе Казацкой и входящем в приход Ильинского храма хуторе Нагорном насчитывался 481 дом с общим количеством прихожан более 3000 человек.