Село Замартынье, основанное более 450 лет назад, получило своё название от реки Мартынчик, названной в честь первого поселенца Мартына. Основным занятием местных жителей было земледелие, что способствовало развитию сельскохозяйственного производства в регионе.
В 1841 году в селе была возведена каменная церковь, освящённая в честь иконы Божией Матери «Боголюбская». Строительство храма было обусловлено потребностью местного населения в духовном центре для отправления религиозных обрядов и укрепления православной веры. Архитектурный облик церкви соответствует канонам русской православной архитектуры того периода, однако подробные сведения о её архитектурных особенностях в доступных источниках отсутствуют.
В 1930-х годах, в период антирелигиозной политики советского государства, храм был закрыт и частично разрушен. Это соответствовало общей тенденции того времени, когда многие религиозные сооружения прекращали свою деятельность или переоборудовались под хозяйственные нужды.
В 1998 году, в период возрождения духовной жизни в России, храм был вновь открыт для богослужений. С этого момента начались работы по его восстановлению, направленные на возвращение первоначального облика и возобновление полноценной религиозной деятельности.