Первоначально часовня была построена в 1907 году в честь рождения наследника российского престола, цесаревича Алексея Николаевича. Строительство было инициировано местными жителями, стремившимися выразить патриотические чувства и увековечить радостное событие в царской семье. Часовня была освящена во имя преподобного Серафима Саровского и святителя Алексия, митрополита Московского. Внутри часовни были установлены доски с именами погибших в русско-японскую войну. Доход от продажи свечей, за вычетом расходов на содержание часовни, направлялся на помощь семьям павших войнов. Автором проекта, по некоторым данным, был архитектор А.Д. Крячков, использовавший мотивы ярославского зодчества. В 1928 году часовня была снесена решением президиума Омского горсовета как не представляющая художественной ценности.
В 1994 году часовня была восстановлена по проекту художника В.А. Десятова. Новое здание представляет собой реплику утраченной постройки, выполненную в традиционном русском стиле. Архитектурный облик включает в себя элементы ярославского зодчества: кирпичные фасады с белокаменными деталями, арочные окна и декоративные кокошники. Часовня увенчана шлемовидным куполом на барабане с щелевидными окнами. Внутреннее убранство оформлено в соответствии с православными канонами, включая иконостас и иконы, выполненные в традиционной иконописной манере.
С момента восстановления часовня стала местом молитвы и памяти для жителей Омска. В ней регулярно проводятся богослужения, включая молебны и панихиды. Часовня также служит местом проведения памятных мероприятий, посвящённых различным церковным праздникам и памятным датам.
