Верхний, шестой ярус колокольни занимает крошечный храм-усыпальня апостола-богослова Иоанна. Он был освящён сразу после нижнего придела и служил монастырской библиотечной часовней: здесь хранился список «Откровения» XIV в., ныне в ГИМ. Площадь помещения всего 16 м², но стены расписаны сложной перспективной росписью «Небесный Иерусалим», выполненной в 1893 году артелью Степана Думнова.
Над входом сохранился автограф архитектора Якова Бухвостова «Я.Б. 1702», открытый при реставрации 2015 г. Посетители видят также редкий механизм — деревянный кривошип колокольного часа 1750 г., восстановленный московскими мастерами-камнерезами. Зимой 2024-25 гг. сюда подняли новолитую 200-кг колоколину по историческому образцу; освятил её патриарх Кирилл 17 января 2025 г.
Из-за ограниченного пространства храм открыт только по пятницам с 12:00 до 15:00, не более 6 человек за подъём. Заранее регистрируйтесь на сайте монастыря.
