Село Алексеевка было основано в XVII веке и в разные периоды принадлежало различным владельцам, включая Голицыных, Карачинских и графиню И. И. Воронцову-Дашкову. В 1788 году, по инициативе прихожан, в селе была построена первая деревянная церковь с колокольней, освящённая во имя преподобного Сергия Радонежского. В 1870 году храм был перестроен, а в 1894 году в нём проводился ремонт. 3 июля 1894 года село посетил протоиерей Иоанн Сергиев, ныне известный как святой праведный Иоанн Кронштадтский, который отслужил в Сергиевской церкви утреню и литургию.
В 1930 году Сергиевская церковь была закрыта, а её здание использовалось под детский сад и впоследствии было разрушено. В 2006 году началось строительство нового храмового комплекса в честь святого праведного Иоанна Кронштадтского. В феврале 2008 года комплекс получил статус подворья Свято-Алексиевского женского монастыря города Саратова. 27 декабря 2008 года епископ Саратовский и Вольский Лонгин совершил чин Великого освящения храма подворья.
