История прихода восходит к 1946 году, когда в городе не осталось действующих церквей.В этот период местная православная община приобрела кирпичный дом, ранее принадлежавший врачу, и переоборудовала его под церковь.С момента основания и на протяжении многих лет этот храм оставался единственным действующим православным приходом в Балакове, выполняя функции центра духовной жизни для горожан и жителей близлежащих районов.
В период с 1946 по 1961 годы в храме сменилось 22 священнослужителя. В 1961 году на должность настоятеля был назначен священник, который прослужил в этом качестве длительное время. При его участии были проведены значительные работы по благоустройству храма: построена сторожка, оборудован подвал с установкой котла отопления, проведены водоснабжение и газификация здания.
В начале 2000-х годов было принято решение о восстановлении и капитальном ремонте храма. В 2007 году проведены работы по ремонту кровли, алтаря, подвальных помещений, системы отопления; обустроен солярный цех. Территория вокруг храма была благоустроена. В 2008 году продолжились ремонтно-реставрационные работы.