Иосифо-Волоцкий монастырь был основан 1 июня 1479 года преподобным Иосифом Волоцким, выходцем из села Язвище близ Волоколамска. Первоначально обитель состояла из деревянных построек, включая часовню и кельи. В 1485 году был освящен первый каменный Успенский собор, расписанный иконописцем Дионисием. Монастырь создавался как общежительный, с строгим уставом, сочетавшим молитву и физический труд.
В начале XVI века монастырь стал крупным духовным и культурным центром. Здесь велось переписывание книг, составлялись богословские труды, включая «Просветитель» преподобного Иосифа. В 1504 году была построена Богоявленская церковь с трапезной палатой. В 1543–1566 годах деревянные стены монастыря заменены на каменные, что усилило его оборонительную функцию.
В XVI–XVII веках монастырь играл роль места заточения для политических и религиозных узников, включая преподобного Максима Грека и царя Василия Шуйского. В Смутное время обитель выдержала осады войск Болотникова и польских отрядов. В 1688–1696 годах на месте старого собора возведен новый Успенский собор в стиле московского барокко.
В XVIII веке монастырь утратил часть земель из-за секуляризационной реформы, но сохранил влияние. В 1777 году при нем открылась школа для детей духовенства. В XIX веке обитель продолжала развиваться, были построены гостиничный корпус и скитский храм Всех Святых.
После революции 1917 года монастырь закрыли, на его территории разместили детский дом. В 1941 году была разрушена колокольня XVI–XVII веков. В 1989 году обитель возвращена Русской Православной Церкви. В 2001 году обретены мощи преподобного Иосифа Волоцкого.