Деревня Ильицино известна с конца XVII века. В 1700 году здесь была построена деревянная Знаменская церковь, освящённая 18 октября того же года. Приход храма включал жителей Ильицино и соседней деревни Бовыкина. Со временем деревянное здание обветшало, и в 1786 году помещица Екатерина Андреевна Гончарова (прабабушка Натальи Гончаровой, жены Александра Пушкина) на собственные средства построила каменную Спасскую церковь в стиле раннего классицизма. Храм был оснащён приделами в честь Знамения и Николая Чудотворца, а также содержал фамильный склеп Гончаровых.
В 1828 году в этой церкви находилась правнучка Екатерины Гончаровой, Наталья Николаевна Гончарова, будущая супруга Александра Пушкина. Она посещала службу и стояла за левым клиросом, что оставило заметный след в её воспоминаниях о детстве.
После революции 1917 года церковь была закрыта, а её здание использовалось для различных хозяйственных нужд, включая мастерскую по ремонту сельскохозяйственной техники. Со временем храм пришёл в запустение и находился в заброшенном состоянии.
В 1999 году, после распада Советского Союза, была создана церковная община, и богослужения были возобновлены. В 2000-х годах начались ремонтные работы, продолжающиеся и по сей день. В августе 2011 года был освящён купольный крест церкви Спаса Нерукотворного Образа. Недалеко от храма находится кладбище, где покоятся многие жители деревни, включая представителей семьи Гончаровых.
Архитектурно церковь представляет собой здание в стиле раннего классицизма с характерными для того времени элементами.
