Село Кишкино известно с начала XV века. В 1723 году оно принадлежало Григорию Григорьевичу Скорнякову-Писареву, участнику Полтавской битвы. В 1736 году в селе была построена деревянная церковь в честь Успения Пресвятой Богородицы с колокольней на каменном фундаменте.
В 1856 году священник Александр Ремизов составил подробное описание церкви, в котором упомянул иконы, такие как Успения Божией Матери с серебряными венцами и преподобного Сергия в киоте из красного дерева. В 1868 году в храме был устроен тёплый придел во имя преподобного Сергия Радонежского, а внешние стены обили тесом, внутренние покрасили масляной краской.
В конце XIX века при священнике Григории Смирнове и церковном старосте Василии Фёдорове на деревянной колокольне были заменены ветхие венцы. В 1901 году по проекту архитектора Николая Корнеева была построена кирпичная трапезная часть храма на месте разобранной старой. В 1908 году началось строительство нового каменного храма по проекту архитектора Ивана Боголепова. Строительство велось с перерывами из-за недостатка средств и было завершено в 1911 году, когда была возведена каменная колокольня.
В 1930-е годы храм был закрыт, настоятеля Петра Любимова и старосту Надежду Абакумову арестовали. Здание использовалось как магазин, а на месте снесённой колокольни оборудовали подсобное помещение. В 1960-е годы по решению местных властей было снесено церковное кладбище, и останки предков были уничтожены.
Осенью 2001 года храм был передан верующим. Приступили к расчистке помещения, обнаружив фрагменты узорной кафельной плитки. С назначением постоянного священника и выселением магазина из храма началась полноценная жизнь прихода, богослужения и реставрационные работы. Летом 2003 года на собранные средства была сооружена 60-метровая ограда. При расчистке внутреннего пространства храма был обнаружен лик преподобного Сергия Радонежского, что воспринималось как благословение для прихожан и благодетелей.
В 2009 году на средства собора Всех святых города Домодедово была заново отстроена колокольня храма. С самого начала возрождения церкви жители села, такие как Александра Фёдоровна Тихомирова, Анна Андреевна Мурашова, Лидия Ивановна Лисицина и Анастасия Ивановна Тамина, активно помогали священнику в службах и строительстве, проявляя пример ревностного служения Богу и людям.
