Основанный в 1681 году, он сыграл значительную роль в духовной и культурной жизни региона, а также в развитии миссионерской деятельности среди народов Сибири и Дальнего Востока.
История основания монастыря связана с трагическими событиями 1650 года, когда на берегу Байкала были убиты члены русского посольства, направленного в Монголию. В память об этих событиях и с целью укрепления православной веры в регионе было принято решение о создании монастыря на месте гибели послов. В 1681 году на этом месте был основан Николаевский скит, ставший впоследствии Посольским Спасо-Преображенским монастырем. Основателями обители стали монахи из Темниковского Санаксарского монастыря во главе с игуменом Феодосием и иеромонахом Макарием. Монастырь был создан по указу царя Фёдора Алексеевича и с благословения патриарха Иоакима. Главной задачей обители была миссионерская деятельность среди бурят, монголов и тунгусов.
В 1700 году к первоначальной часовне был пристроен алтарь, и она была освящена как церковь во имя святителя Николая Чудотворца. С этого момента заимка начала называться Посольским монастырем. Значительный вклад в развитие монастыря внес купец Григорий Афанасьевич Осколков, который пожертвовал средства на строительство церкви, заготовил строительные материалы, построил кельи и подарил монастырю скотный двор. Осколков скончался в 1714 году, его тело было доставлено в монастырь и погребено здесь.
В 1724 году монастырь был приписан к Иркутскому Вознесенскому монастырю, однако в 1727 году по указу Сената и Синода Посольский монастырь был сохранен как самостоятельная обитель. В 1735 году было установлено почтовое сообщение от монастыря до Кяхты. После пожара 1769 года, уничтожившего большинство зданий, началось строительство нового собора с нижним приделом во имя иконы Знамения Пресвятой Богородицы и верхним — в честь Преображения Господня. В 1777 году монастырь был ограблен беглыми каторжниками, после чего здесь был размещен казачий караул с артиллерийской батареей.
В 1802–1812 годах была построена Никольская церковь, освященная в 1812 году. В 1820 году была заложена кирпичная надвратная церковь. С 1861 по 1918 год в монастыре располагалась резиденция Забайкальской духовной миссии. В 1836 году монастырь был возведен во второй класс монастырей, что повлекло увеличение штата и привилегий. В 1864 году были построены каменные ворота с калитками, в 1866 году — гостиница у пристани, в 1868 году — часовня над могилой посла Заболоцкого. В 1870 году были построены зимовье, амбар и здание телеграфной станции. В 1873 году монастырь посетил Великий князь Алексей Александрович.
После Октябрьской революции монастырь был закрыт, большинство его сооружений были разобраны в 1930-х годах. В 1950-х годах были разрушены световой этаж и купола Спасо-Преображенского собора. До 1995 года здания монастыря использовались под клуб, школу и детскую психиатрическую больницу. Архив монастыря погиб в 1917 году во время пожара архиерейского дома.
В 1995 году в Свято-Никольском храме монастыря был образован православный приход. В 2000 году приход был преобразован в монастырь, началось возрождение монашеской жизни. В 2002 году были установлены новые колокола, начались ремонтно-реставрационные работы главного храма — Спасо-Преображенского собора. В настоящее время в храме Святителя Николая Чудотворца ежедневно совершается суточный круг богослужений. Монастырь является памятником архитектуры федерального значения и охраняется государством.
Архитектурный ансамбль монастыря включает Спасо-Преображенский собор, построенный после пожара 1769 года, Никольскую церковь, освященную в 1812 году, и надвратную церковь, заложенную в 1820 году. Здания выполнены в традиционном русском стиле с элементами сибирского зодчества. Монастырь расположен на берегу озера Байкал.
