По преданию, Варваринский монастырь был основан в память княгини Иулиании Волоцкой, супруги князя Бориса Васильевича Волоцкого, скончавшейся в 1503 году. Первоначально монастырь назывался Покровским, а затем был переименован в Варваринский. До конца XVII века все постройки монастыря, включая церкви, были деревянными. Согласно описанию 1626 года, в обители имелись деревянные церкви Успения Пресвятой Богородицы и великомученицы Варвары, причём последняя описывалась как ветхая.
В 1695 году по указу царицы Натальи Кирилловны Нарышкиной, матери Петра I, была построена каменная церковь в честь Покрова Пресвятой Богородицы. Этот храм стал соборным в монастыре и заменил собой прежние деревянные постройки.
В 1764 году, в ходе секуляризационной реформы, Варваринский монастырь был упразднён, и Покровская церковь стала приходским храмом. В 1803 году из-за ветхости была разобрана соседняя, более древняя, Покровская церковь, и Успенская церковь получила в память о ней наименование Покровской. В 1806 году к южной стороне храма был пристроен придел в честь Успения Пресвятой Богородицы. В трапезной части церкви были устроены два придела: северный — во имя святого мученика Уара и южный — во имя святой великомученицы Варвары.
В 1870 году трапезная была расширена, а в 1878 году по проекту архитектора С. В. Дмитриева надстроена новая колокольня. В интерьере храма сохранились иконы XVIII века, а также деревянная скульптура Николы Можайского из села Черленкова. Настенные росписи, выполненные в академическом стиле, были обновлены в 1966 году.
В годы советской власти Покровский храм оставался действующим, несмотря на репрессии, коснувшиеся его священнослужителей и прихожан. В 1932 году священник Владимир Покровский был сослан в Казахстан, но после возвращения в 1935 году вновь стал служить в храме. Диакон Владимир Осташёвский был выслан и убит в ссылке, а церковный староста Кузьма Николаевич Матвеев расстрелян на Бутовском полигоне.
