Николаевский женский монастырь в Алатыре основан в XVII веке. Первые документальные упоминания относятся к 1639 году, когда обитель уже существовала как самостоятельный монастырь. Изначально монастырь был мужским, но в 1764 году упразднен в ходе секуляризационной реформы Екатерины II.
В 1817 году монастырь возобновлен как женский. Главный храм обители - Никольский собор - построен в 1730-х годах в стиле барокко. В 1823 году к собору пристроен теплый придел в честь Покрова Пресвятой Богородицы. В 1859 году возведена каменная колокольня высотой 58 метров.
В XIX веке монастырь владел 33 десятинами земли. При обители действовали школа и больница для насельниц. В 1903 году построена каменная ограда с четырьмя башнями. К 1917 году в монастыре проживало 45 монахинь и 145 послушниц.
В 1925 году монастырь закрыт советскими властями. Здания использовались под склады и жилые помещения. В 1994 году монастырь возвращен Русской Православной Церкви. Началось восстановление разрушенных храмов и построек. В 2001 году завершена реставрация Никольского собора.
Архитектурный ансамбль монастыря включает: Никольский собор (1730-е), Покровский придел (1823), колокольню (1859), келейные корпуса (XIX в.) и фрагменты ограды (1903). Сохранились фрагменты росписей XIX века в интерьере собора.
