Обитель основана в 1995 году на месте гибели членов императорской семьи и их приближённых в 1918 году.
В ночь на 18 июля 1918 года в шахту рудника Нижняя Селимская были сброшены Великая княгиня Елизавета Фёдоровна, инокиня Варвара, Великий князь Сергей Михайлович, князья императорской крови Иоанн, Константин и Игорь Константиновичи, князь Владимир Палей и Фёдор Ремез.
В конце 1980-х годов XX века было установлено местонахождение шахты, где произошли эти события. В 1991 году на этом месте был установлен Поклонный крест. В 1992 году рядом с шахтой была построена часовня во имя святой преподобномученицы Елисаветы, в которой 18 июля 1992 года была отслужена первая Божественная литургия под предстоятельством архиепископа Свердловского и Курганского Мелхиседека.
22 февраля 1995 года Священный Синод Русской Православной Церкви принял решение об учреждении на этом месте мужского монастыря в честь Новомучеников Российских. Строителем монастыря был назначен иеромонах Моисей (Пилатс). Районными властями было выделено 32 гектара земли, после чего началось обустройство обители. 6 июля 1996 года был заложен первый камень под строительство монастырского храма, освящение которого состоялось 18 июля 2001 года архиепископом Екатеринбургским и Верхотурским Викентием.
В настоящее время монастырский комплекс включает в себя Памятный крест над шахтой, четырёхэтажное кирпичное здание с храмом и братским корпусом, часовню во имя святой преподобномученицы Елисаветы, входные врата и хозяйственные постройки. Братия монастыря осуществляет миссионерскую деятельность в Алапаевске и прилегающем районе, а также занимается хозяйственной деятельностью, обеспечивая себя продуктами и, по возможности, помогая малоимущим.
В монастырском храме хранятся частицы мощей святых преподобномучениц Елисаветы Фёдоровны и инокини Варвары, привезённые из Иерусалима. На территории обители также находится святой источник «Романовский».
