Первое упоминание о церкви в селе Хомяково относится к XVI веку, когда здесь существовал деревянный храм в честь Казанской иконы Божией Матери. С течением времени деревянная постройка обветшала, и возникла необходимость в строительстве нового храма.
В 1805 году на месте старой деревянной церкви был возведен каменный храм в стиле классицизма. Архитектурно здание представляет собой типичную для того времени конструкцию «восьмерик на четверике» с трапезной и колокольней, увенчанной шпилем. Храм стал духовным центром не только для жителей Хомяково, но и для окрестных деревень.
В период 1930-х годов, в эпоху гонений на церковь, Казанский храм был закрыт, а его имущество конфисковано. Здание использовалось не по назначению, что привело к его постепенному разрушению.
В 1991 году храм был возвращен Русской Православной Церкви. С этого времени начались восстановительные работы, направленные на возвращение храму его первоначального облика и возрождение духовной жизни прихода.
