В XVI веке на территории современного Жуковского существовал монастырь Иоанна Предтечи, основанный в 1581 году по указу царя Ивана Грозного. Монастырь был возведен у переправы через Москву-реку и служил не только духовным центром, но и стратегическим пунктом на пути из Москвы в Коломну. Однако после Смутного времени монастырь пришел в запустение и был упразднен. На его месте возникло село Новорождествено, где в 1631 году была построена небольшая деревянная церковь в честь Рождества Иоанна Предтечи.
В 1710 году Петр I пожаловал село Новорождествено и Раменскую волость графу Ивану Алексеевичу Мусину-Пушкину за заслуги в подавлении Астраханского восстания. В 1730 году его сын, граф Платон Иванович Мусин-Пушкин, возвел на месте ветхой деревянной церкви каменный двухэтажный храм. В нижнем этаже располагался теплый придел во имя святителя Николая Чудотворца, а верхний этаж был посвящен Рождеству Иоанна Предтечи.
Архитектура храма сочетала элементы традиционного русского зодчества с барочными чертами, характерными для первой половины XVIII века. Храм имел богатое внутреннее убранство: иконостас с позолоченными киотами, мраморную лестницу на второй этаж и множество старинных икон, среди которых особо почиталась Новодворская икона Божией Матери в серебряной ризе. Церковный хор славился в округе своим мастерством.
После революции 1917 года село Новорождествено было переименовано в Новое. В 1937 году храм был закрыт, а в 1940 году взорван. Территория была разровнена и засыпана песком, а на месте села Новорождествено возник город Жуковский.
В 1997 году, спустя более полувека после разрушения храма, на его месте был установлен и освящен крест, а также отслужены молебен и панихида. В 1998 году начались археологические раскопки, в ходе которых были обнаружены фундаменты старого храма. На этом месте было решено построить новый деревянный храм по проекту архитектора Е. Константинова. Уже 19 декабря 1998 года в строящемся храме состоялась первая Божественная литургия.
В период с 1999 по 2003 годы на территории храма были построены трапезная, колодец, сторожка и историко-археологическая избушка. В октябре 2006 года было получено благословение митрополита Крутицкого и Коломенского Ювеналия на строительство храма во имя новомучеников Жуковских рядом с Иоанно-Предтеченским.
В настоящее время Иоанно-Предтеченский храм является действующим и регулярно проводит богослужения в выходные и праздничные дни. При храме действует музей села Новорождествено, где представлены историко-археологические находки, обнаруженные при раскопках фундамента разрушенного храма. Экспозиция музея дает представление об укладе жизни людей, проживавших на этой территории в прошлом.
Храм также занимается активной социальной и культурной деятельностью. Организуются экскурсии по храму и музею, действуют ремесленные мастерские и вокальный ансамбль "Елей".
