Село Михалёво расположено на левом берегу Москвы-реки и имеет древнюю историю. В XIV веке оно входило в состав дворцовой волости Гвоздна, упоминаемой в духовных грамотах Ивана Калиты (1336–1339). Центром волости был погост Гвоздна с деревянной церковью во имя святых Космы и Дамиана, предположительно построенной в 1247 году. К приходу этой церкви относились и жители деревни Михалёво.
В 1796 году, после восшествия на престол императора Павла I, большая часть Гвозднинской волости была передана в «вечное и потомственное владение» придворному лейб-медику Ивану Филипповичу Беку. Выйдя в отставку в 1802 году, Бек выбрал деревню Михалёво для строительства своей усадьбы, что положило начало преобразованию деревни в значимое поместье.
В 1818 году сын Ивана Филипповича, Александр Иванович Бек, начал строительство каменного храма в честь Рождества Христова. Согласно некоторым источникам, А.И. Бек самостоятельно разработал архитектурный проект церкви. Однако высокий художественный уровень постройки и сходство архитектурных приёмов со школой Матвея Фёдоровича Казакова позволяют предположить участие учеников этого выдающегося архитектора.
Строительство храма было завершено в 1821 году. В 1825 году центральный престол освятили в честь Рождества Христова, а два боковых — во имя святого благоверного князя Александра Невского и святых бессребреников Космы и Дамиана. Архитектурно церковь представляет собой кирпичное оштукатуренное здание с белокаменными деталями, выполненное в стиле зрелого классицизма. Основной объём завершён купольной ротондой, боковые фасады украшены четырёхколонными портиками с треугольными фронтонами.
В 1930-х годах, в период антирелигиозной политики советского государства, храм был закрыт. Иконы из иконостаса были уничтожены, а само здание использовалось как склад удобрений, что привело к его постепенному разрушению.
В 1991 году, после изменения государственной политики в отношении религии, церковь Рождества Христова была возвращена верующим в руинированном состоянии. Благодаря усилиям местной общины и духовенства, храм был полностью восстановлен. В 2006 году, по благословению митрополита Крутицкого и Коломенского Ювеналия, церковь была освящена архиепископом Можайским Григорием.
