Первое упоминание о селе Аношкино относится к 1659 году, когда служилый человек Анофрий Голобоков основал поселение на левом берегу Дона. По другим данным, название села связано с солдатом Онуфрием (Аношкой), встретившим Петра I во время Азовского похода 1696 года. Царь пожаловал поселению икону Иоанна Богослова, которая долгое время хранилась в местной церкви.
Первая деревянная церковь в честь Воскресения Господня была построена в Аношкине вскоре после 1696 года. В 1730 году при храме служил священник Максим, а с 1742 года - Кондрат Абрамов. Каменный храм Вознесения Господня был возведен в 1789 году на месте прежней деревянной церкви. В 1844 году к зданию были пристроены боковые приделы, а в 1874 году надстроен второй ярус колокольни.
В конце XIX века приход храма насчитывал 387 дворов и 2753 прихожанина. В штате церкви состояли священник, диакон и псаломщик. Храм владел 33 десятинами пахотной земли и получал проценты с капитала в 300 рублей.
В 1930 году последний настоятель храма был расстрелян вместе с семьей у стен церкви. Здание было закрыто и разграблено, колокола уничтожены. В 1950-х годах в храме пытались организовать пуговичное производство, затем использовали как скотобойню и зернохранилище.
Восстановление храма началось в 1992 году. Во время расчистки здания в 1994 году были обнаружены останки расстрелянной семьи священника, которые перезахоронили за алтарем. В 1996 году на купол храма был установлен новый крест. В процессе реставрации отмечались случаи обновления икон и настенных росписей.