Согласно архивным данным, первая деревянная церковь в селе Тимонькино существовала к 1747 году. В 1814 году на месте ветхой деревянной церкви была построена каменная церковь с алтарем, помещением для молящихся и колокольней. В 1890 году церковь была обнесена каменной оградой. Храм имел три престола: главный — в честь Воздвижения Честного и Животворящего Креста Господня, а также приделы в честь святых Первоверховных апостолов Петра и Павла и в честь Введения во храм Пресвятой Богородицы.
На приходе храма состояло 1400 православных отставных военных и крестьян с семьями, проживающих в селе Тимонькино и двенадцати близлежащих деревнях. С 1815 по 1934 год в храме служили одиннадцать священников и трое церковных старост.
В 1935 году храм был закрыт и разрушен. Местные жители вспоминают, что еще в 1950-х годах церковь стояла, в ней находился клуб, на месте алтаря была сцена, а на хорах располагалась галерка. Позже к зданию храма пристроили кинобудку, стали показывать кино. В 1970-е годы разрушили колокольню, а потом и саму церковь.
В настоящее время от храма остались лишь остатки стен из красного кирпича. В 2015 году, в праздник Воздвижения Честного и Животворящего Креста Господня, в селе Тимонькино состоялось освящение Поклонного Креста, установленного возле полуразрушенного храма.